Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Tmod1P49813 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Tmod1P49813 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Tmod1P49813 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Tmod1P49813 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Tmod1P49813 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Tmod1P49813 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmod1P49813 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
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