Protein–RNA interactions for Protein: P48316

Gadd45a, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45aP48316 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gadd45aP48316 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms