Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VdrP48281 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VdrP48281 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VdrP48281 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VdrP48281 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VdrP48281 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VdrP48281 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VdrP48281 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VdrP48281 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VdrP48281 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VdrP48281 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VdrP48281 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VdrP48281 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VdrP48281 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VdrP48281 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VdrP48281 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VdrP48281 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VdrP48281 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VdrP48281 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VdrP48281 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VdrP48281 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VdrP48281 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VdrP48281 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VdrP48281 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VdrP48281 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VdrP48281 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VdrP48281 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VdrP48281 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VdrP48281 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VdrP48281 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VdrP48281 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VdrP48281 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VdrP48281 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VdrP48281 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VdrP48281 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VdrP48281 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VdrP48281 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VdrP48281 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VdrP48281 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VdrP48281 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VdrP48281 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VdrP48281 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VdrP48281 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VdrP48281 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VdrP48281 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VdrP48281 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VdrP48281 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VdrP48281 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VdrP48281 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VdrP48281 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VdrP48281 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VdrP48281 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VdrP48281 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VdrP48281 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VdrP48281 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VdrP48281 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VdrP48281 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VdrP48281 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VdrP48281 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VdrP48281 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
VdrP48281 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VdrP48281 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VdrP48281 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VdrP48281 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VdrP48281 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VdrP48281 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VdrP48281 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VdrP48281 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VdrP48281 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VdrP48281 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
VdrP48281 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VdrP48281 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VdrP48281 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VdrP48281 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VdrP48281 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VdrP48281 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VdrP48281 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VdrP48281 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VdrP48281 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VdrP48281 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VdrP48281 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VdrP48281 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VdrP48281 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VdrP48281 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VdrP48281 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VdrP48281 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VdrP48281 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VdrP48281 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VdrP48281 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VdrP48281 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VdrP48281 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VdrP48281 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VdrP48281 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VdrP48281 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VdrP48281 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VdrP48281 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VdrP48281 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VdrP48281 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VdrP48281 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VdrP48281 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms