Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms