Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab11bP46638 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rab11bP46638 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rab11bP46638 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rab11bP46638 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rab11bP46638 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rab11bP46638 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rab11bP46638 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rab11bP46638 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rab11bP46638 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rab11bP46638 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rab11bP46638 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rab11bP46638 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rab11bP46638 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rab11bP46638 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rab11bP46638 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rab11bP46638 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rab11bP46638 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rab11bP46638 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rab11bP46638 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rab11bP46638 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rab11bP46638 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rab11bP46638 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms