Protein–RNA interactions for Protein: P43687

Hmx2, Homeobox protein HMX2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx2P43687 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hmx2P43687 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms