Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl28P41105 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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