Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk2P38575 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk2P38575 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk2P38575 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk2P38575 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk2P38575 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk2P38575 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk2P38575 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk2P38575 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Upk2P38575 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk2P38575 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Upk2P38575 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk2P38575 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk2P38575 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Upk2P38575 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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