Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptpn1P35821 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms