Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pola2P33611 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pola2P33611 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pola2P33611 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pola2P33611 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms