Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa10P31310 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa10P31310 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms