Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxraP28700 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RxraP28700 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxraP28700 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxraP28700 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxraP28700 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxraP28700 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxraP28700 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxraP28700 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxraP28700 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxraP28700 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxraP28700 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxraP28700 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxraP28700 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxraP28700 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxraP28700 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RxraP28700 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RxraP28700 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RxraP28700 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RxraP28700 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RxraP28700 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RxraP28700 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RxraP28700 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RxraP28700 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RxraP28700 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RxraP28700 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RxraP28700 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RxraP28700 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RxraP28700 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RxraP28700 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RxraP28700 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RxraP28700 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RxraP28700 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RxraP28700 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RxraP28700 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RxraP28700 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RxraP28700 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RxraP28700 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RxraP28700 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RxraP28700 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RxraP28700 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RxraP28700 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RxraP28700 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxraP28700 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxraP28700 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxraP28700 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxraP28700 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxraP28700 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxraP28700 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RxraP28700 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxraP28700 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxraP28700 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxraP28700 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RxraP28700 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RxraP28700 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxraP28700 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RxraP28700 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxraP28700 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RxraP28700 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxraP28700 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxraP28700 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxraP28700 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxraP28700 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxraP28700 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxraP28700 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxraP28700 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxraP28700 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxraP28700 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxraP28700 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxraP28700 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxraP28700 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxraP28700 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RxraP28700 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxraP28700 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxraP28700 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxraP28700 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxraP28700 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxraP28700 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxraP28700 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RxraP28700 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxraP28700 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxraP28700 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxraP28700 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxraP28700 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RxraP28700 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxraP28700 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxraP28700 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxraP28700 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxraP28700 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxraP28700 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxraP28700 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxraP28700 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxraP28700 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxraP28700 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxraP28700 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxraP28700 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxraP28700 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxraP28700 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxraP28700 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxraP28700 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms