Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd9P28357 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd9P28357 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms