Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gjb1P28230 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms