Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav1P27870 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav1P27870 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vav1P27870 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav1P27870 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav1P27870 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vav1P27870 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vav1P27870 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vav1P27870 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms