Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpbP27790 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpbP27790 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpbP27790 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenpbP27790 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenpbP27790 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpbP27790 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpbP27790 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpbP27790 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpbP27790 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpbP27790 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpbP27790 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpbP27790 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpbP27790 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpbP27790 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms