Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnna1P26231 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna1P26231 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms