Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccnd1P25322 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnd1P25322 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms