Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NdnP25233 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NdnP25233 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NdnP25233 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NdnP25233 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NdnP25233 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NdnP25233 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NdnP25233 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NdnP25233 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NdnP25233 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NdnP25233 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NdnP25233 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NdnP25233 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NdnP25233 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NdnP25233 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NdnP25233 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NdnP25233 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NdnP25233 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NdnP25233 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NdnP25233 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NdnP25233 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NdnP25233 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NdnP25233 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NdnP25233 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NdnP25233 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NdnP25233 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NdnP25233 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
NdnP25233 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NdnP25233 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NdnP25233 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
NdnP25233 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NdnP25233 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
NdnP25233 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NdnP25233 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NdnP25233 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NdnP25233 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NdnP25233 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NdnP25233 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NdnP25233 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NdnP25233 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NdnP25233 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NdnP25233 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NdnP25233 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NdnP25233 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NdnP25233 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NdnP25233 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NdnP25233 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NdnP25233 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NdnP25233 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NdnP25233 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NdnP25233 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NdnP25233 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NdnP25233 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NdnP25233 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NdnP25233 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NdnP25233 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NdnP25233 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NdnP25233 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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NdnP25233 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NdnP25233 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NdnP25233 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NdnP25233 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NdnP25233 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NdnP25233 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NdnP25233 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NdnP25233 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NdnP25233 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NdnP25233 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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