Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd8P23463 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd8P23463 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd8P23463 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd8P23463 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd8P23463 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd8P23463 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd8P23463 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd8P23463 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd8P23463 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd8P23463 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd8P23463 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd8P23463 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd8P23463 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd8P23463 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd8P23463 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd8P23463 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd8P23463 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd8P23463 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd8P23463 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd8P23463 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd8P23463 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd8P23463 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd8P23463 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd8P23463 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd8P23463 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd8P23463 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd8P23463 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd8P23463 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms