Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcb1aP21447 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms