Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BdnfP21237 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BdnfP21237 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BdnfP21237 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BdnfP21237 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BdnfP21237 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BdnfP21237 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BdnfP21237 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms