Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ntf3P20181 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms