Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lama1P19137 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama1P19137 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama1P19137 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama1P19137 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama1P19137 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama1P19137 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama1P19137 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama1P19137 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama1P19137 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama1P19137 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama1P19137 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama1P19137 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama1P19137 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama1P19137 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama1P19137 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms