Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18528 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18528 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18528 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18528 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
P18528 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18528 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18528 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18528 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18528 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18528 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18528 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P18528 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18528 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18528 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18528 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18528 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18528 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18528 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18528 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18528 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18528 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18528 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18528 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18528 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18528 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18528 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18528 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18528 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18528 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18528 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18528 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18528 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18528 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18528 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18528 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms