Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou4f1P17208 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou4f1P17208 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou4f1P17208 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou4f1P17208 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pou4f1P17208 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou4f1P17208 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou4f1P17208 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou4f1P17208 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou4f1P17208 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou4f1P17208 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou4f1P17208 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou4f1P17208 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou4f1P17208 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou4f1P17208 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pou4f1P17208 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou4f1P17208 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms