Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms