Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp53P15975 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp53P15975 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp53P15975 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp53P15975 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp53P15975 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms