Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-D1P14427 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-D1P14427 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms