Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd1P13516 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd1P13516 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd1P13516 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd1P13516 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Scd1P13516 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd1P13516 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd1P13516 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd1P13516 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd1P13516 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd1P13516 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms