Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vpreb1P13372 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms