Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnmt3cP0DOY1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnmt3cP0DOY1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms