Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Amd1P0DMN7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms