Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxa9P09631 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa9P09631 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms