Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax1P09084 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax1P09084 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax1P09084 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax1P09084 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax1P09084 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax1P09084 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pax1P09084 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms