Protein–RNA interactions for Protein: P09023

Hoxb6, Homeobox protein Hox-B6, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb6P09023 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb6P09023 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb6P09023 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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