Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1P07141 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1P07141 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf1P07141 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf1P07141 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms