Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa4P06798 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms