Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgamP05555 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgamP05555 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgamP05555 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgamP05555 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgamP05555 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgamP05555 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ItgamP05555 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms