Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tgfb1P04202 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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