Protein–RNA interactions for Protein: P03987

Ig gamma-3 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P03987 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P03987 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P03987 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P03987 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P03987 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P03987 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P03987 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P03987 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P03987 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P03987 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P03987 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P03987 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P03987 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P03987 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P03987 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P03987 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P03987 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P03987 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P03987 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P03987 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P03987 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P03987 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P03987 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P03987 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P03987 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P03987 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P03987 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P03987 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P03987 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P03987 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P03987 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P03987 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P03987 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P03987 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P03987 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P03987 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P03987 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P03987 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P03987 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms