Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01654 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01654 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01654 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01654 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01654 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01654 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01654 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01654 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01654 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01654 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01654 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01654 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01654 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01654 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01654 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01654 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01654 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01654 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01654 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01654 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01654 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01654 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01654 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01654 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01654 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01654 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01654 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01654 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01654 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01654 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01654 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01654 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01654 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01654 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01654 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01654 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01654 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01654 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01654 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01654 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01654 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01654 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01654 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01654 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01654 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01654 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01654 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01654 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01654 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01654 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01654 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01654 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01654 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01654 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01654 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01654 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01654 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01654 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01654 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01654 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01654 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01654 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01654 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01654 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01654 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01654 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01654 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01654 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01654 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01654 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01654 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01654 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01654 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01654 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01654 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01654 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01654 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01654 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01654 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01654 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01654 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01654 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01654 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01654 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01654 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01654 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01654 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01654 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01654 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01654 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01654 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01654 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01654 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01654 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01654 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01654 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01654 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01654 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01654 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms