Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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MscO88940 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MscO88940 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MscO88940 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MscO88940 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MscO88940 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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MscO88940 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MscO88940 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MscO88940 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MscO88940 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MscO88940 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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MscO88940 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MscO88940 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MscO88940 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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MscO88940 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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MscO88940 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MscO88940 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MscO88940 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MscO88940 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MscO88940 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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MscO88940 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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MscO88940 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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MscO88940 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MscO88940 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MscO88940 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MscO88940 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MscO88940 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MscO88940 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MscO88940 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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MscO88940 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MscO88940 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MscO88940 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MscO88940 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MscO88940 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MscO88940 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MscO88940 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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