Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sap30O88574 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sap30O88574 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sap30O88574 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sap30O88574 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms