Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd46O88174 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd46O88174 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cd46O88174 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd46O88174 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd46O88174 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cd46O88174 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd46O88174 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd46O88174 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cd46O88174 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd46O88174 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd46O88174 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cd46O88174 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cd46O88174 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cd46O88174 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd46O88174 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd46O88174 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd46O88174 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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