Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psma3O70435 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma3O70435 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma3O70435 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma3O70435 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psma3O70435 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms