Protein–RNA interactions for Protein: O70238

Rhox6, Homeobox protein PSX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox6O70238 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox6O70238 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox6O70238 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox6O70238 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox6O70238 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox6O70238 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox6O70238 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox6O70238 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox6O70238 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox6O70238 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox6O70238 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox6O70238 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox6O70238 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox6O70238 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox6O70238 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox6O70238 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox6O70238 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox6O70238 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox6O70238 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox6O70238 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox6O70238 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox6O70238 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox6O70238 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox6O70238 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox6O70238 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox6O70238 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox6O70238 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox6O70238 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox6O70238 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox6O70238 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rhox6O70238 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms