Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chrna4O70174 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms