Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap2O55126 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms