Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syngr2O55101 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syngr2O55101 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syngr2O55101 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syngr2O55101 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syngr2O55101 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Syngr2O55101 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syngr2O55101 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Syngr2O55101 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Syngr2O55101 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syngr2O55101 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syngr2O55101 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syngr2O55101 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syngr2O55101 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syngr2O55101 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syngr2O55101 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syngr2O55101 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syngr2O55101 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syngr2O55101 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syngr2O55101 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syngr2O55101 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syngr2O55101 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syngr2O55101 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syngr2O55101 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syngr2O55101 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Syngr2O55101 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Syngr2O55101 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Syngr2O55101 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Syngr2O55101 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms